MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.03

Total Repeats: 910

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019752	ACA	2	6	138	143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303527
2	NC_019752	AGCCAA	2	12	146	157	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428303527
3	NC_019752	A	6	6	210	215	100 %	0 %	0 %	0 %	428303527
4	NC_019752	ACA	2	6	261	266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303527
5	NC_019752	CTG	2	6	276	281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303527
6	NC_019752	T	6	6	392	397	0 %	100 %	0 %	0 %	428303527
7	NC_019752	AAT	2	6	398	403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303527
8	NC_019752	ACT	2	6	404	409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303527
9	NC_019752	T	8	8	428	435	0 %	100 %	0 %	0 %	428303527
10	NC_019752	GAA	2	6	494	499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303527
11	NC_019752	ATT	2	6	500	505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303527
12	NC_019752	TACT	2	8	538	545	25 %	50 %	0 %	25 %	428303527
13	NC_019752	TAA	2	6	580	585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303527
14	NC_019752	AAT	2	6	661	666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303527
15	NC_019752	ATT	2	6	689	694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303527
16	NC_019752	ATT	2	6	788	793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303527
17	NC_019752	CAA	2	6	802	807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303527
18	NC_019752	A	6	6	816	821	100 %	0 %	0 %	0 %	428303527
19	NC_019752	TTA	2	6	875	880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303527
20	NC_019752	AT	3	6	898	903	50 %	50 %	0 %	0 %	428303527
21	NC_019752	TAA	2	6	994	999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303527
22	NC_019752	CAA	2	6	1013	1018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303527
23	NC_019752	ATA	2	6	1113	1118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303527
24	NC_019752	TC	3	6	1121	1126	0 %	50 %	0 %	50 %	428303527
25	NC_019752	ATT	2	6	1131	1136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303527
26	NC_019752	TTG	2	6	1149	1154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303527
27	NC_019752	AAT	2	6	1214	1219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303527
28	NC_019752	TAAT	2	8	1278	1285	50 %	50 %	0 %	0 %	428303527
29	NC_019752	GAAA	2	8	1297	1304	75 %	0 %	25 %	0 %	428303527
30	NC_019752	AATA	2	8	1313	1320	75 %	25 %	0 %	0 %	428303527
31	NC_019752	C	7	7	1737	1743	0 %	0 %	0 %	100 %	428303528
32	NC_019752	CAT	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303528
33	NC_019752	GCC	2	6	1840	1845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303528
34	NC_019752	AGC	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303528
35	NC_019752	CTG	2	6	1947	1952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303528
36	NC_019752	CACC	2	8	2003	2010	25 %	0 %	0 %	75 %	428303528
37	NC_019752	CGA	2	6	2081	2086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303528
38	NC_019752	AAAT	2	8	2116	2123	75 %	25 %	0 %	0 %	428303528
39	NC_019752	CTC	2	6	2188	2193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303529
40	NC_019752	CAA	2	6	2195	2200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303529
41	NC_019752	CCTTC	2	10	2220	2229	0 %	40 %	0 %	60 %	428303529
42	NC_019752	CTT	2	6	2333	2338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303529
43	NC_019752	T	6	6	2410	2415	0 %	100 %	0 %	0 %	428303529
44	NC_019752	TCA	2	6	2428	2433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303529
45	NC_019752	ATC	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303530
46	NC_019752	GGC	2	6	2607	2612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303530
47	NC_019752	GCC	2	6	2657	2662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303530
48	NC_019752	CGA	2	6	2668	2673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303530
49	NC_019752	CCA	2	6	2730	2735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303530
50	NC_019752	TTGC	2	8	2803	2810	0 %	50 %	25 %	25 %	428303530
51	NC_019752	AAC	2	6	2831	2836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303530
52	NC_019752	ATG	2	6	2863	2868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303530
53	NC_019752	CCCTT	2	10	2895	2904	0 %	40 %	0 %	60 %	428303530
54	NC_019752	TCCAAA	2	12	2930	2941	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428303530
55	NC_019752	CT	3	6	2968	2973	0 %	50 %	0 %	50 %	428303530
56	NC_019752	TCT	2	6	3057	3062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303530
57	NC_019752	GCC	2	6	3185	3190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303530
58	NC_019752	CCT	2	6	3210	3215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303530
59	NC_019752	CAAC	2	8	3228	3235	50 %	0 %	0 %	50 %	428303530
60	NC_019752	CCA	2	6	3297	3302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303530
61	NC_019752	CAT	2	6	3331	3336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303530
62	NC_019752	A	7	7	3337	3343	100 %	0 %	0 %	0 %	428303530
63	NC_019752	CAA	2	6	3409	3414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303530
64	NC_019752	CAT	3	9	3462	3470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303530
65	NC_019752	AAGC	2	8	3693	3700	50 %	0 %	25 %	25 %	428303531
66	NC_019752	TGC	2	6	3710	3715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303531
67	NC_019752	ATG	2	6	3845	3850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303531
68	NC_019752	TTC	2	6	3915	3920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303531
69	NC_019752	CGA	2	6	3927	3932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303531
70	NC_019752	TA	3	6	3951	3956	50 %	50 %	0 %	0 %	428303531
71	NC_019752	GAA	2	6	3997	4002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303531
72	NC_019752	AGA	2	6	4122	4127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303532
73	NC_019752	GAA	2	6	4159	4164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303532
74	NC_019752	AAG	2	6	4254	4259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303532
75	NC_019752	GTA	2	6	4286	4291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303532
76	NC_019752	ATG	2	6	4292	4297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303532
77	NC_019752	A	7	7	4345	4351	100 %	0 %	0 %	0 %	428303532
78	NC_019752	ACA	2	6	4369	4374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303532
79	NC_019752	GGA	2	6	4411	4416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303532
80	NC_019752	GGC	2	6	4509	4514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303532
81	NC_019752	ACA	2	6	4534	4539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303532
82	NC_019752	AAT	2	6	4542	4547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303532
83	NC_019752	AGA	2	6	4587	4592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303532
84	NC_019752	TGA	2	6	4620	4625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303532
85	NC_019752	AAC	2	6	4637	4642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303532
86	NC_019752	GGA	2	6	4662	4667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303532
87	NC_019752	GTT	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303532
88	NC_019752	AGA	2	6	4722	4727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303532
89	NC_019752	A	6	6	4745	4750	100 %	0 %	0 %	0 %	428303532
90	NC_019752	GCTT	2	8	4755	4762	0 %	50 %	25 %	25 %	428303532
91	NC_019752	CAAA	2	8	4763	4770	75 %	0 %	0 %	25 %	428303532
92	NC_019752	TAAA	2	8	4775	4782	75 %	25 %	0 %	0 %	428303532
93	NC_019752	CAA	2	6	4870	4875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303532
94	NC_019752	AGA	4	12	4887	4898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303532
95	NC_019752	A	8	8	4900	4907	100 %	0 %	0 %	0 %	428303532
96	NC_019752	TGA	2	6	4989	4994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303532
97	NC_019752	TAG	2	6	5039	5044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303532
98	NC_019752	TAA	2	6	5049	5054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303532
99	NC_019752	ATT	2	6	5122	5127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303532
100	NC_019752	TGC	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303532
101	NC_019752	TGC	2	6	5247	5252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303532
102	NC_019752	TAA	2	6	5334	5339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303532
103	NC_019752	GAT	2	6	5359	5364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303532
104	NC_019752	GTC	2	6	5414	5419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303532
105	NC_019752	GTG	2	6	5510	5515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303532
106	NC_019752	CTA	2	6	5627	5632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303532
107	NC_019752	TC	3	6	5675	5680	0 %	50 %	0 %	50 %	428303533
108	NC_019752	A	6	6	5711	5716	100 %	0 %	0 %	0 %	428303533
109	NC_019752	ATAA	2	8	5725	5732	75 %	25 %	0 %	0 %	428303533
110	NC_019752	TAA	2	6	5781	5786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303533
111	NC_019752	ACA	2	6	5810	5815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303533
112	NC_019752	TAT	2	6	5824	5829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303533
113	NC_019752	AGA	2	6	5862	5867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303533
114	NC_019752	AG	4	8	5917	5924	50 %	0 %	50 %	0 %	428303533
115	NC_019752	CAC	2	6	5933	5938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303533
116	NC_019752	T	8	8	5939	5946	0 %	100 %	0 %	0 %	428303533
117	NC_019752	ATC	2	6	6011	6016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303533
118	NC_019752	GTT	2	6	6161	6166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303534
119	NC_019752	GAA	2	6	6203	6208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303534
120	NC_019752	GA	3	6	6234	6239	50 %	0 %	50 %	0 %	428303534
121	NC_019752	AATT	2	8	6285	6292	50 %	50 %	0 %	0 %	428303534
122	NC_019752	AC	3	6	6296	6301	50 %	0 %	0 %	50 %	428303534
123	NC_019752	GTG	2	6	6333	6338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303534
124	NC_019752	GTT	2	6	6365	6370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303534
125	NC_019752	T	7	7	6465	6471	0 %	100 %	0 %	0 %	428303535
126	NC_019752	TGA	2	6	6474	6479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303535
127	NC_019752	ACT	2	6	6486	6491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303535
128	NC_019752	AATT	2	8	6498	6505	50 %	50 %	0 %	0 %	428303535
129	NC_019752	TGGA	2	8	6515	6522	25 %	25 %	50 %	0 %	428303535
130	NC_019752	TTGG	2	8	6602	6609	0 %	50 %	50 %	0 %	428303535
131	NC_019752	CAA	2	6	6622	6627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303535
132	NC_019752	GTC	2	6	6674	6679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303535
133	NC_019752	AT	3	6	6689	6694	50 %	50 %	0 %	0 %	428303535
134	NC_019752	TCA	2	6	6747	6752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303536
135	NC_019752	TTC	2	6	6797	6802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303536
136	NC_019752	ATC	2	6	6848	6853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303536
137	NC_019752	CAG	2	6	6950	6955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303537
138	NC_019752	ATT	2	6	6982	6987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303537
139	NC_019752	AGA	2	6	7032	7037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303537
140	NC_019752	GAT	2	6	7081	7086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303537
141	NC_019752	GCA	2	6	7114	7119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303537
142	NC_019752	GAT	2	6	7135	7140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303537
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144	NC_019752	TGT	2	6	7286	7291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303537
145	NC_019752	TAAT	2	8	7348	7355	50 %	50 %	0 %	0 %	428303537
146	NC_019752	AT	3	6	7365	7370	50 %	50 %	0 %	0 %	428303538
147	NC_019752	A	6	6	7383	7388	100 %	0 %	0 %	0 %	428303538
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152	NC_019752	CA	3	6	7614	7619	50 %	0 %	0 %	50 %	428303538
153	NC_019752	GAAT	2	8	7709	7716	50 %	25 %	25 %	0 %	428303538
154	NC_019752	TTG	2	6	7730	7735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303538
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161	NC_019752	TTGG	2	8	7910	7917	0 %	50 %	50 %	0 %	428303539
162	NC_019752	ATG	2	6	7927	7932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303539
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164	NC_019752	CAA	2	6	7945	7950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303540
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171	NC_019752	TAA	2	6	9863	9868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303541
172	NC_019752	TGT	2	6	9874	9879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303541
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251	NC_019752	CT	3	6	14373	14378	0 %	50 %	0 %	50 %	428303544
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265	NC_019752	AGT	2	6	15231	15236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303546
266	NC_019752	T	6	6	15257	15262	0 %	100 %	0 %	0 %	428303546
267	NC_019752	CCCA	2	8	15351	15358	25 %	0 %	0 %	75 %	428303546
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287	NC_019752	A	6	6	16730	16735	100 %	0 %	0 %	0 %	428303548
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383	NC_019752	AAT	2	6	22591	22596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303551
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389	NC_019752	AAT	2	6	22720	22725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303551
390	NC_019752	AATT	2	8	22742	22749	50 %	50 %	0 %	0 %	428303551
391	NC_019752	GTA	2	6	22811	22816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303551
392	NC_019752	TCC	2	6	22871	22876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303551
393	NC_019752	TGT	2	6	22975	22980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303551
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395	NC_019752	ACC	2	6	23037	23042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303551
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